Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrxO55103 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrxO55103 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrxO55103 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrxO55103 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrxO55103 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrxO55103 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PrxO55103 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrxO55103 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrxO55103 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrxO55103 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrxO55103 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrxO55103 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrxO55103 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrxO55103 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrxO55103 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrxO55103 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrxO55103 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrxO55103 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrxO55103 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrxO55103 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrxO55103 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrxO55103 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrxO55103 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrxO55103 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrxO55103 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrxO55103 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrxO55103 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrxO55103 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrxO55103 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrxO55103 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrxO55103 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrxO55103 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrxO55103 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrxO55103 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrxO55103 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrxO55103 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PrxO55103 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PrxO55103 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrxO55103 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrxO55103 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrxO55103 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrxO55103 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrxO55103 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrxO55103 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PrxO55103 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrxO55103 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrxO55103 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrxO55103 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrxO55103 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrxO55103 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrxO55103 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrxO55103 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrxO55103 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrxO55103 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrxO55103 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrxO55103 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrxO55103 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrxO55103 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrxO55103 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PrxO55103 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrxO55103 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrxO55103 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrxO55103 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrxO55103 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PrxO55103 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrxO55103 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PrxO55103 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrxO55103 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrxO55103 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrxO55103 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrxO55103 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrxO55103 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrxO55103 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrxO55103 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrxO55103 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrxO55103 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrxO55103 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrxO55103 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrxO55103 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrxO55103 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrxO55103 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrxO55103 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrxO55103 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrxO55103 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrxO55103 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrxO55103 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrxO55103 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrxO55103 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrxO55103 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrxO55103 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrxO55103 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrxO55103 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrxO55103 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrxO55103 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrxO55103 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrxO55103 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrxO55103 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrxO55103 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrxO55103 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms