Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms