Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BckdkO55028 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BckdkO55028 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BckdkO55028 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BckdkO55028 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BckdkO55028 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BckdkO55028 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BckdkO55028 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BckdkO55028 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BckdkO55028 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BckdkO55028 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BckdkO55028 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BckdkO55028 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BckdkO55028 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BckdkO55028 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BckdkO55028 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BckdkO55028 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BckdkO55028 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BckdkO55028 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BckdkO55028 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BckdkO55028 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BckdkO55028 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BckdkO55028 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BckdkO55028 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BckdkO55028 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BckdkO55028 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BckdkO55028 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BckdkO55028 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BckdkO55028 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BckdkO55028 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BckdkO55028 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BckdkO55028 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
BckdkO55028 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
BckdkO55028 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BckdkO55028 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
BckdkO55028 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BckdkO55028 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BckdkO55028 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BckdkO55028 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BckdkO55028 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BckdkO55028 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BckdkO55028 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BckdkO55028 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BckdkO55028 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BckdkO55028 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
BckdkO55028 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BckdkO55028 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BckdkO55028 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BckdkO55028 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BckdkO55028 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BckdkO55028 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
BckdkO55028 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
BckdkO55028 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BckdkO55028 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BckdkO55028 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BckdkO55028 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BckdkO55028 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BckdkO55028 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BckdkO55028 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
BckdkO55028 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
BckdkO55028 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BckdkO55028 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
BckdkO55028 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BckdkO55028 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BckdkO55028 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BckdkO55028 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BckdkO55028 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BckdkO55028 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BckdkO55028 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
BckdkO55028 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
BckdkO55028 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BckdkO55028 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BckdkO55028 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BckdkO55028 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BckdkO55028 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BckdkO55028 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BckdkO55028 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BckdkO55028 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BckdkO55028 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BckdkO55028 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BckdkO55028 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BckdkO55028 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BckdkO55028 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BckdkO55028 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BckdkO55028 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BckdkO55028 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BckdkO55028 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BckdkO55028 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BckdkO55028 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BckdkO55028 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
BckdkO55028 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BckdkO55028 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
BckdkO55028 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BckdkO55028 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BckdkO55028 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BckdkO55028 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BckdkO55028 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BckdkO55028 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BckdkO55028 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
BckdkO55028 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms