Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms