Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SlkO54988 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SlkO54988 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SlkO54988 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SlkO54988 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SlkO54988 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SlkO54988 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SlkO54988 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SlkO54988 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SlkO54988 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SlkO54988 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SlkO54988 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SlkO54988 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SlkO54988 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SlkO54988 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SlkO54988 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SlkO54988 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SlkO54988 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SlkO54988 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SlkO54988 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SlkO54988 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SlkO54988 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SlkO54988 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SlkO54988 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SlkO54988 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SlkO54988 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SlkO54988 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SlkO54988 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SlkO54988 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SlkO54988 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SlkO54988 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SlkO54988 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SlkO54988 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SlkO54988 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SlkO54988 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SlkO54988 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SlkO54988 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SlkO54988 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SlkO54988 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SlkO54988 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SlkO54988 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SlkO54988 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SlkO54988 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SlkO54988 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SlkO54988 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SlkO54988 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SlkO54988 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SlkO54988 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SlkO54988 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SlkO54988 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SlkO54988 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SlkO54988 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SlkO54988 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SlkO54988 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SlkO54988 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SlkO54988 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SlkO54988 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SlkO54988 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SlkO54988 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SlkO54988 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SlkO54988 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SlkO54988 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SlkO54988 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SlkO54988 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SlkO54988 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SlkO54988 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SlkO54988 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SlkO54988 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SlkO54988 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SlkO54988 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SlkO54988 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SlkO54988 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SlkO54988 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SlkO54988 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SlkO54988 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SlkO54988 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SlkO54988 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SlkO54988 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SlkO54988 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SlkO54988 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SlkO54988 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SlkO54988 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SlkO54988 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SlkO54988 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SlkO54988 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SlkO54988 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SlkO54988 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SlkO54988 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SlkO54988 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SlkO54988 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SlkO54988 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SlkO54988 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SlkO54988 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SlkO54988 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SlkO54988 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SlkO54988 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SlkO54988 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SlkO54988 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SlkO54988 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SlkO54988 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms