Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn5O54942 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn5O54942 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn5O54942 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn5O54942 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn5O54942 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn5O54942 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn5O54942 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn5O54942 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn5O54942 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn5O54942 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn5O54942 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn5O54942 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn5O54942 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn5O54942 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn5O54942 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn5O54942 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn5O54942 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn5O54942 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn5O54942 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn5O54942 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn5O54942 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn5O54942 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn5O54942 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn5O54942 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms