Protein–RNA interactions for Protein: O54799

Nmbr, Neuromedin-B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbrO54799 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NmbrO54799 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NmbrO54799 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NmbrO54799 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NmbrO54799 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NmbrO54799 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NmbrO54799 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NmbrO54799 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NmbrO54799 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NmbrO54799 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NmbrO54799 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NmbrO54799 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NmbrO54799 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NmbrO54799 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NmbrO54799 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NmbrO54799 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NmbrO54799 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NmbrO54799 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NmbrO54799 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NmbrO54799 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NmbrO54799 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NmbrO54799 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NmbrO54799 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NmbrO54799 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NmbrO54799 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NmbrO54799 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NmbrO54799 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms