Protein–RNA interactions for Protein: O54785

Limk2, LIM domain kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk2O54785 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Limk2O54785 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Limk2O54785 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Limk2O54785 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms