Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CrxO54751 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CrxO54751 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CrxO54751 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CrxO54751 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CrxO54751 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CrxO54751 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CrxO54751 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CrxO54751 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CrxO54751 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CrxO54751 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CrxO54751 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CrxO54751 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CrxO54751 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CrxO54751 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CrxO54751 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CrxO54751 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CrxO54751 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CrxO54751 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CrxO54751 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CrxO54751 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CrxO54751 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CrxO54751 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CrxO54751 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CrxO54751 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CrxO54751 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CrxO54751 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CrxO54751 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CrxO54751 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CrxO54751 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CrxO54751 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CrxO54751 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CrxO54751 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CrxO54751 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CrxO54751 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CrxO54751 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CrxO54751 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CrxO54751 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CrxO54751 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CrxO54751 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CrxO54751 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CrxO54751 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CrxO54751 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CrxO54751 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CrxO54751 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CrxO54751 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CrxO54751 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CrxO54751 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CrxO54751 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CrxO54751 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CrxO54751 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CrxO54751 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CrxO54751 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CrxO54751 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CrxO54751 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CrxO54751 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CrxO54751 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CrxO54751 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CrxO54751 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CrxO54751 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CrxO54751 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CrxO54751 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CrxO54751 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CrxO54751 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CrxO54751 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CrxO54751 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CrxO54751 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CrxO54751 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CrxO54751 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CrxO54751 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CrxO54751 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CrxO54751 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CrxO54751 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CrxO54751 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CrxO54751 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CrxO54751 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CrxO54751 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CrxO54751 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CrxO54751 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CrxO54751 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CrxO54751 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CrxO54751 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CrxO54751 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CrxO54751 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CrxO54751 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CrxO54751 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CrxO54751 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CrxO54751 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CrxO54751 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CrxO54751 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CrxO54751 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CrxO54751 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CrxO54751 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CrxO54751 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CrxO54751 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CrxO54751 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CrxO54751 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CrxO54751 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CrxO54751 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CrxO54751 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms