Protein–RNA interactions for Protein: O54724

Cavin1, Caveolae-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin1O54724 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cavin1O54724 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms