Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pik3cdO35904 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pik3cdO35904 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pik3cdO35904 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pik3cdO35904 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pik3cdO35904 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pik3cdO35904 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pik3cdO35904 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pik3cdO35904 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pik3cdO35904 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pik3cdO35904 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pik3cdO35904 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pik3cdO35904 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pik3cdO35904 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pik3cdO35904 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pik3cdO35904 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pik3cdO35904 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pik3cdO35904 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pik3cdO35904 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pik3cdO35904 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pik3cdO35904 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pik3cdO35904 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pik3cdO35904 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pik3cdO35904 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pik3cdO35904 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pik3cdO35904 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pik3cdO35904 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pik3cdO35904 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pik3cdO35904 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pik3cdO35904 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pik3cdO35904 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pik3cdO35904 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pik3cdO35904 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pik3cdO35904 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pik3cdO35904 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pik3cdO35904 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pik3cdO35904 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pik3cdO35904 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pik3cdO35904 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pik3cdO35904 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pik3cdO35904 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pik3cdO35904 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pik3cdO35904 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pik3cdO35904 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pik3cdO35904 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pik3cdO35904 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pik3cdO35904 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pik3cdO35904 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pik3cdO35904 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pik3cdO35904 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pik3cdO35904 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pik3cdO35904 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pik3cdO35904 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pik3cdO35904 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pik3cdO35904 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pik3cdO35904 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pik3cdO35904 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pik3cdO35904 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pik3cdO35904 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pik3cdO35904 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pik3cdO35904 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pik3cdO35904 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms