Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stag2O35638 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Stag2O35638 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stag2O35638 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stag2O35638 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stag2O35638 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Stag2O35638 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Stag2O35638 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Stag2O35638 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stag2O35638 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stag2O35638 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stag2O35638 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stag2O35638 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stag2O35638 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stag2O35638 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stag2O35638 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stag2O35638 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stag2O35638 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Stag2O35638 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stag2O35638 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stag2O35638 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stag2O35638 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stag2O35638 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stag2O35638 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stag2O35638 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Stag2O35638 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stag2O35638 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stag2O35638 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stag2O35638 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stag2O35638 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stag2O35638 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stag2O35638 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stag2O35638 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stag2O35638 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stag2O35638 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stag2O35638 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stag2O35638 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stag2O35638 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stag2O35638 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stag2O35638 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stag2O35638 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stag2O35638 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Stag2O35638 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stag2O35638 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stag2O35638 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stag2O35638 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stag2O35638 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stag2O35638 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stag2O35638 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stag2O35638 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stag2O35638 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Stag2O35638 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stag2O35638 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stag2O35638 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stag2O35638 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stag2O35638 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stag2O35638 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stag2O35638 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stag2O35638 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stag2O35638 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stag2O35638 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stag2O35638 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stag2O35638 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stag2O35638 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stag2O35638 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stag2O35638 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stag2O35638 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stag2O35638 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stag2O35638 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stag2O35638 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stag2O35638 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stag2O35638 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stag2O35638 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms