Protein–RNA interactions for Protein: O35473

C1d, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1dO35473 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1dO35473 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1dO35473 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1dO35473 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1dO35473 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1dO35473 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1dO35473 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1dO35473 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1dO35473 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1dO35473 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1dO35473 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1dO35473 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1dO35473 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1dO35473 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1dO35473 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1dO35473 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1dO35473 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1dO35473 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1dO35473 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1dO35473 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1dO35473 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1dO35473 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1dO35473 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1dO35473 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1dO35473 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1dO35473 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1dO35473 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1dO35473 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1dO35473 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1dO35473 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1dO35473 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1dO35473 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1dO35473 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1dO35473 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1dO35473 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1dO35473 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1dO35473 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1dO35473 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1dO35473 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1dO35473 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1dO35473 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C1dO35473 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1dO35473 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1dO35473 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1dO35473 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1dO35473 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1dO35473 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1dO35473 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1dO35473 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1dO35473 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1dO35473 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1dO35473 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1dO35473 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1dO35473 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1dO35473 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1dO35473 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1dO35473 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1dO35473 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1dO35473 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1dO35473 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1dO35473 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C1dO35473 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1dO35473 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1dO35473 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1dO35473 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1dO35473 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1dO35473 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1dO35473 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1dO35473 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1dO35473 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1dO35473 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1dO35473 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1dO35473 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1dO35473 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1dO35473 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C1dO35473 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1dO35473 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1dO35473 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1dO35473 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1dO35473 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1dO35473 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1dO35473 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1dO35473 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1dO35473 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1dO35473 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1dO35473 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1dO35473 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1dO35473 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C1dO35473 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C1dO35473 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C1dO35473 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C1dO35473 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C1dO35473 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C1dO35473 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C1dO35473 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C1dO35473 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1dO35473 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1dO35473 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1dO35473 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C1dO35473 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms