Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Prrt1O35449 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Prrt1O35449 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Prrt1O35449 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrt1O35449 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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