Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Xbp1O35426 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Xbp1O35426 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Xbp1O35426 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Xbp1O35426 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Xbp1O35426 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Xbp1O35426 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Xbp1O35426 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xbp1O35426 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms