Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxd2O35392 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
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