Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Ptpn9O35239 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Ptpn9O35239 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Ptpn9O35239 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Ptpn9O35239 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Ptpn9O35239 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn9O35239 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Ptpn9O35239 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Ptpn9O35239 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn9O35239 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn9O35239 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Ptpn9O35239 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn9O35239 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Ptpn9O35239 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn9O35239 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn9O35239 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn9O35239 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn9O35239 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn9O35239 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn9O35239 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn9O35239 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn9O35239 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn9O35239 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn9O35239 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn9O35239 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn9O35239 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn9O35239 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn9O35239 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Ptpn9O35239 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms