Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad6O35182 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad6O35182 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad6O35182 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms