Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Polr1aO35134 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Polr1aO35134 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Polr1aO35134 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Polr1aO35134 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Polr1aO35134 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Polr1aO35134 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Polr1aO35134 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Polr1aO35134 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Polr1aO35134 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Polr1aO35134 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Polr1aO35134 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms