Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn4O35054 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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