Protein–RNA interactions for Protein: O09102

Gcm2, Chorion-specific transcription factor GCMb, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcm2O09102 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms