Protein–RNA interactions for Protein: O09044

Snap23, Synaptosomal-associated protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap23O09044 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snap23O09044 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snap23O09044 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snap23O09044 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snap23O09044 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snap23O09044 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snap23O09044 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snap23O09044 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Snap23O09044 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Snap23O09044 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snap23O09044 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snap23O09044 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snap23O09044 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snap23O09044 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Snap23O09044 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snap23O09044 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Snap23O09044 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Snap23O09044 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snap23O09044 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snap23O09044 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snap23O09044 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snap23O09044 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snap23O09044 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snap23O09044 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snap23O09044 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snap23O09044 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snap23O09044 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snap23O09044 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snap23O09044 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Snap23O09044 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snap23O09044 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snap23O09044 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snap23O09044 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snap23O09044 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snap23O09044 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snap23O09044 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snap23O09044 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snap23O09044 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snap23O09044 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snap23O09044 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snap23O09044 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snap23O09044 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snap23O09044 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snap23O09044 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snap23O09044 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snap23O09044 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snap23O09044 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snap23O09044 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snap23O09044 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snap23O09044 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snap23O09044 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snap23O09044 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snap23O09044 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snap23O09044 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snap23O09044 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snap23O09044 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snap23O09044 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snap23O09044 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snap23O09044 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snap23O09044 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snap23O09044 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snap23O09044 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snap23O09044 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snap23O09044 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snap23O09044 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snap23O09044 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snap23O09044 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snap23O09044 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snap23O09044 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Snap23O09044 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snap23O09044 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snap23O09044 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Snap23O09044 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Snap23O09044 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Snap23O09044 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Snap23O09044 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Snap23O09044 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Snap23O09044 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snap23O09044 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Snap23O09044 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snap23O09044 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snap23O09044 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snap23O09044 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snap23O09044 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Snap23O09044 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snap23O09044 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snap23O09044 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snap23O09044 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snap23O09044 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Snap23O09044 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Snap23O09044 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snap23O09044 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snap23O09044 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snap23O09044 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snap23O09044 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snap23O09044 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snap23O09044 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snap23O09044 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snap23O09044 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snap23O09044 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms