Protein–RNA interactions for Protein: O08919

Numbl, Numb-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NumblO08919 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NumblO08919 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NumblO08919 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NumblO08919 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NumblO08919 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NumblO08919 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NumblO08919 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NumblO08919 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NumblO08919 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NumblO08919 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NumblO08919 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NumblO08919 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NumblO08919 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NumblO08919 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NumblO08919 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NumblO08919 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NumblO08919 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NumblO08919 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NumblO08919 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NumblO08919 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NumblO08919 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NumblO08919 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NumblO08919 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NumblO08919 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NumblO08919 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NumblO08919 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NumblO08919 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NumblO08919 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NumblO08919 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NumblO08919 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NumblO08919 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NumblO08919 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NumblO08919 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NumblO08919 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NumblO08919 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NumblO08919 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NumblO08919 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NumblO08919 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NumblO08919 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NumblO08919 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NumblO08919 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NumblO08919 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NumblO08919 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NumblO08919 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NumblO08919 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NumblO08919 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NumblO08919 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NumblO08919 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NumblO08919 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NumblO08919 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NumblO08919 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NumblO08919 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NumblO08919 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NumblO08919 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NumblO08919 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NumblO08919 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NumblO08919 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NumblO08919 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NumblO08919 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NumblO08919 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NumblO08919 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NumblO08919 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NumblO08919 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NumblO08919 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NumblO08919 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NumblO08919 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NumblO08919 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NumblO08919 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NumblO08919 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NumblO08919 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NumblO08919 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NumblO08919 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NumblO08919 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NumblO08919 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NumblO08919 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NumblO08919 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NumblO08919 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NumblO08919 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NumblO08919 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NumblO08919 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NumblO08919 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NumblO08919 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NumblO08919 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NumblO08919 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NumblO08919 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NumblO08919 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NumblO08919 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NumblO08919 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NumblO08919 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NumblO08919 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NumblO08919 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NumblO08919 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NumblO08919 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NumblO08919 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NumblO08919 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NumblO08919 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NumblO08919 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NumblO08919 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
NumblO08919 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NumblO08919 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms