Protein–RNA interactions for Protein: O08644

Ephb6, Ephrin type-B receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb6O08644 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ephb6O08644 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms