Protein–RNA interactions for Protein: L7N219

Gm5458, Predicted gene 5458, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5458L7N219 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms