Protein–RNA interactions for Protein: K9J7H2

Gm4141, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4141K9J7H2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm4141K9J7H2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm4141K9J7H2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm4141K9J7H2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm4141K9J7H2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm4141K9J7H2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm4141K9J7H2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm4141K9J7H2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm4141K9J7H2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm4141K9J7H2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm4141K9J7H2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm4141K9J7H2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm4141K9J7H2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm4141K9J7H2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm4141K9J7H2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm4141K9J7H2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm4141K9J7H2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm4141K9J7H2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm4141K9J7H2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm4141K9J7H2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm4141K9J7H2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm4141K9J7H2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm4141K9J7H2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm4141K9J7H2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm4141K9J7H2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm4141K9J7H2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm4141K9J7H2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm4141K9J7H2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm4141K9J7H2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm4141K9J7H2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm4141K9J7H2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm4141K9J7H2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm4141K9J7H2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm4141K9J7H2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm4141K9J7H2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm4141K9J7H2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm4141K9J7H2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm4141K9J7H2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm4141K9J7H2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm4141K9J7H2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm4141K9J7H2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm4141K9J7H2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm4141K9J7H2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm4141K9J7H2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm4141K9J7H2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm4141K9J7H2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm4141K9J7H2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm4141K9J7H2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm4141K9J7H2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm4141K9J7H2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm4141K9J7H2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm4141K9J7H2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm4141K9J7H2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm4141K9J7H2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm4141K9J7H2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm4141K9J7H2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm4141K9J7H2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm4141K9J7H2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm4141K9J7H2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm4141K9J7H2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm4141K9J7H2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm4141K9J7H2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm4141K9J7H2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm4141K9J7H2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm4141K9J7H2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm4141K9J7H2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm4141K9J7H2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm4141K9J7H2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm4141K9J7H2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm4141K9J7H2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm4141K9J7H2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm4141K9J7H2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm4141K9J7H2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm4141K9J7H2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm4141K9J7H2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm4141K9J7H2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm4141K9J7H2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm4141K9J7H2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm4141K9J7H2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm4141K9J7H2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm4141K9J7H2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm4141K9J7H2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm4141K9J7H2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm4141K9J7H2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm4141K9J7H2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm4141K9J7H2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm4141K9J7H2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm4141K9J7H2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm4141K9J7H2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm4141K9J7H2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm4141K9J7H2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm4141K9J7H2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm4141K9J7H2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm4141K9J7H2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm4141K9J7H2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm4141K9J7H2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm4141K9J7H2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm4141K9J7H2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm4141K9J7H2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm4141K9J7H2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms