Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
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