Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ccdc180J3QNE4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ccdc180J3QNE4 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ccdc180J3QNE4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ccdc180J3QNE4 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Ccdc180J3QNE4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ccdc180J3QNE4 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Ccdc180J3QNE4 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ccdc180J3QNE4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ccdc180J3QNE4 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ccdc180J3QNE4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ccdc180J3QNE4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccdc180J3QNE4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccdc180J3QNE4 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccdc180J3QNE4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccdc180J3QNE4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccdc180J3QNE4 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccdc180J3QNE4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccdc180J3QNE4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccdc180J3QNE4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccdc180J3QNE4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccdc180J3QNE4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccdc180J3QNE4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccdc180J3QNE4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccdc180J3QNE4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc180J3QNE4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc180J3QNE4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc180J3QNE4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc180J3QNE4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc180J3QNE4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc180J3QNE4 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc180J3QNE4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc180J3QNE4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc180J3QNE4 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc180J3QNE4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc180J3QNE4 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc180J3QNE4 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc180J3QNE4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc180J3QNE4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc180J3QNE4 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc180J3QNE4 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ccdc180J3QNE4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ccdc180J3QNE4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ccdc180J3QNE4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ccdc180J3QNE4 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Ccdc180J3QNE4 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Ccdc180J3QNE4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ccdc180J3QNE4 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ccdc180J3QNE4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ccdc180J3QNE4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ccdc180J3QNE4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ccdc180J3QNE4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ccdc180J3QNE4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ccdc180J3QNE4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ccdc180J3QNE4 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Ccdc180J3QNE4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ccdc180J3QNE4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ccdc180J3QNE4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ccdc180J3QNE4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ccdc180J3QNE4 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Ccdc180J3QNE4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ccdc180J3QNE4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ccdc180J3QNE4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccdc180J3QNE4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms