Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Gm20918J3QN17 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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