Protein–RNA interactions for Protein: J3QJX6

7530416G11Rik, RIKEN cDNA 7530416G11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
7530416G11RikJ3QJX6 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms