Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tubgcp6G5E8P0 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms