Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms