Protein–RNA interactions for Protein: G3UWE6

Vmn1r39, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r39G3UWE6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r39G3UWE6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms