Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms