Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
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