Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms