Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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