Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Gm28038F7BCN9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Gm28038F7BCN9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Gm28038F7BCN9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Gm28038F7BCN9 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Gm28038F7BCN9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Gm28038F7BCN9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Gm28038F7BCN9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Gm28038F7BCN9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Gm28038F7BCN9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Gm28038F7BCN9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
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