Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms