Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5861F6VCN9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5861F6VCN9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5861F6VCN9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5861F6VCN9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5861F6VCN9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5861F6VCN9 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5861F6VCN9 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5861F6VCN9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5861F6VCN9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5861F6VCN9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5861F6VCN9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5861F6VCN9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5861F6VCN9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5861F6VCN9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5861F6VCN9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5861F6VCN9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5861F6VCN9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5861F6VCN9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5861F6VCN9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5861F6VCN9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5861F6VCN9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5861F6VCN9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5861F6VCN9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5861F6VCN9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5861F6VCN9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5861F6VCN9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5861F6VCN9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5861F6VCN9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5861F6VCN9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5861F6VCN9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5861F6VCN9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5861F6VCN9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5861F6VCN9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5861F6VCN9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5861F6VCN9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5861F6VCN9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5861F6VCN9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5861F6VCN9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5861F6VCN9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5861F6VCN9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5861F6VCN9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5861F6VCN9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5861F6VCN9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5861F6VCN9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5861F6VCN9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5861F6VCN9 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5861F6VCN9 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5861F6VCN9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5861F6VCN9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5861F6VCN9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5861F6VCN9 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5861F6VCN9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5861F6VCN9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5861F6VCN9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5861F6VCN9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5861F6VCN9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5861F6VCN9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5861F6VCN9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5861F6VCN9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5861F6VCN9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5861F6VCN9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5861F6VCN9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5861F6VCN9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5861F6VCN9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5861F6VCN9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5861F6VCN9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5861F6VCN9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5861F6VCN9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5861F6VCN9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5861F6VCN9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5861F6VCN9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5861F6VCN9 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5861F6VCN9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5861F6VCN9 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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