Protein–RNA interactions for Protein: F6UK53

4933403O08Rik, MCG62900, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933403O08RikF6UK53 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.07■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.07■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.07■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.07■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.07■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.06■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.06■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4933403O08RikF6UK53 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4933403O08RikF6UK53 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.05■□□□□ -0
4933403O08RikF6UK53 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4933403O08RikF6UK53 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
4933403O08RikF6UK53 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4933403O08RikF6UK53 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4933403O08RikF6UK53 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4933403O08RikF6UK53 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4933403O08RikF6UK53 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4933403O08RikF6UK53 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4933403O08RikF6UK53 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4933403O08RikF6UK53 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4933403O08RikF6UK53 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4933403O08RikF6UK53 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4933403O08RikF6UK53 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4933403O08RikF6UK53 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4933403O08RikF6UK53 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
4933403O08RikF6UK53 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4933403O08RikF6UK53 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4933403O08RikF6UK53 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4933403O08RikF6UK53 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4933403O08RikF6UK53 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4933403O08RikF6UK53 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4933403O08RikF6UK53 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4933403O08RikF6UK53 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4933403O08RikF6UK53 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
4933403O08RikF6UK53 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4933403O08RikF6UK53 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.04■□□□□ -0
4933403O08RikF6UK53 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4933403O08RikF6UK53 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4933403O08RikF6UK53 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4933403O08RikF6UK53 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.04■□□□□ -0
4933403O08RikF6UK53 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4933403O08RikF6UK53 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
4933403O08RikF6UK53 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4933403O08RikF6UK53 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4933403O08RikF6UK53 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4933403O08RikF6UK53 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4933403O08RikF6UK53 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4933403O08RikF6UK53 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
4933403O08RikF6UK53 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
4933403O08RikF6UK53 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4933403O08RikF6UK53 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms