Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17555F6U8B9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17555F6U8B9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17555F6U8B9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17555F6U8B9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17555F6U8B9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17555F6U8B9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17555F6U8B9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17555F6U8B9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17555F6U8B9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17555F6U8B9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17555F6U8B9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17555F6U8B9 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17555F6U8B9 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17555F6U8B9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17555F6U8B9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17555F6U8B9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17555F6U8B9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17555F6U8B9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17555F6U8B9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17555F6U8B9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17555F6U8B9 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17555F6U8B9 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17555F6U8B9 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17555F6U8B9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17555F6U8B9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17555F6U8B9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17555F6U8B9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17555F6U8B9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17555F6U8B9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17555F6U8B9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17555F6U8B9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17555F6U8B9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17555F6U8B9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17555F6U8B9 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms