Protein–RNA interactions for Protein: F6U3N7

Gm21977, Predicted gene 21977 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21977F6U3N7 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm21977F6U3N7 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm21977F6U3N7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm21977F6U3N7 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm21977F6U3N7 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm21977F6U3N7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm21977F6U3N7 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm21977F6U3N7 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm21977F6U3N7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm21977F6U3N7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm21977F6U3N7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm21977F6U3N7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm21977F6U3N7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm21977F6U3N7 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm21977F6U3N7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm21977F6U3N7 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm21977F6U3N7 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm21977F6U3N7 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm21977F6U3N7 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm21977F6U3N7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm21977F6U3N7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm21977F6U3N7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm21977F6U3N7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm21977F6U3N7 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm21977F6U3N7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm21977F6U3N7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm21977F6U3N7 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm21977F6U3N7 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm21977F6U3N7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm21977F6U3N7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm21977F6U3N7 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm21977F6U3N7 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm21977F6U3N7 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm21977F6U3N7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm21977F6U3N7 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm21977F6U3N7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm21977F6U3N7 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm21977F6U3N7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm21977F6U3N7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm21977F6U3N7 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm21977F6U3N7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm21977F6U3N7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm21977F6U3N7 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm21977F6U3N7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm21977F6U3N7 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm21977F6U3N7 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm21977F6U3N7 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm21977F6U3N7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm21977F6U3N7 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm21977F6U3N7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm21977F6U3N7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm21977F6U3N7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm21977F6U3N7 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm21977F6U3N7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm21977F6U3N7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm21977F6U3N7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm21977F6U3N7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm21977F6U3N7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm21977F6U3N7 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm21977F6U3N7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm21977F6U3N7 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm21977F6U3N7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm21977F6U3N7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm21977F6U3N7 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm21977F6U3N7 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm21977F6U3N7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm21977F6U3N7 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm21977F6U3N7 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm21977F6U3N7 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm21977F6U3N7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm21977F6U3N7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm21977F6U3N7 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm21977F6U3N7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm21977F6U3N7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm21977F6U3N7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm21977F6U3N7 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm21977F6U3N7 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm21977F6U3N7 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm21977F6U3N7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm21977F6U3N7 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm21977F6U3N7 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm21977F6U3N7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm21977F6U3N7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm21977F6U3N7 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm21977F6U3N7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm21977F6U3N7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm21977F6U3N7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm21977F6U3N7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm21977F6U3N7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm21977F6U3N7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm21977F6U3N7 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm21977F6U3N7 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm21977F6U3N7 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm21977F6U3N7 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm21977F6U3N7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm21977F6U3N7 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm21977F6U3N7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm21977F6U3N7 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm21977F6U3N7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm21977F6U3N7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms