Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms