Protein–RNA interactions for Protein: F6RXI4

BC067074, cDNA sequence BC067074, mousemouse

Predictions only

Length 2,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC067074F6RXI4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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BC067074F6RXI4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BC067074F6RXI4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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