Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3U3

Raph1, Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raph1F2Z3U3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms