Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8Q6

Ccdc141, Coiled-coil domain-containing 141, mousemouse

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc141E9Q8Q6 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc141E9Q8Q6 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc141E9Q8Q6 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc141E9Q8Q6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc141E9Q8Q6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc141E9Q8Q6 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc141E9Q8Q6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc141E9Q8Q6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc141E9Q8Q6 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc141E9Q8Q6 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc141E9Q8Q6 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc141E9Q8Q6 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc141E9Q8Q6 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc141E9Q8Q6 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc141E9Q8Q6 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc141E9Q8Q6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc141E9Q8Q6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc141E9Q8Q6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc141E9Q8Q6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc141E9Q8Q6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc141E9Q8Q6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc141E9Q8Q6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc141E9Q8Q6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc141E9Q8Q6 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc141E9Q8Q6 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc141E9Q8Q6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc141E9Q8Q6 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc141E9Q8Q6 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc141E9Q8Q6 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc141E9Q8Q6 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc141E9Q8Q6 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc141E9Q8Q6 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc141E9Q8Q6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc141E9Q8Q6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc141E9Q8Q6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc141E9Q8Q6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc141E9Q8Q6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc141E9Q8Q6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc141E9Q8Q6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc141E9Q8Q6 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc141E9Q8Q6 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc141E9Q8Q6 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc141E9Q8Q6 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc141E9Q8Q6 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc141E9Q8Q6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc141E9Q8Q6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc141E9Q8Q6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc141E9Q8Q6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc141E9Q8Q6 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc141E9Q8Q6 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc141E9Q8Q6 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc141E9Q8Q6 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc141E9Q8Q6 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc141E9Q8Q6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc141E9Q8Q6 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc141E9Q8Q6 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc141E9Q8Q6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc141E9Q8Q6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc141E9Q8Q6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc141E9Q8Q6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc141E9Q8Q6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc141E9Q8Q6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc141E9Q8Q6 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc141E9Q8Q6 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc141E9Q8Q6 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc141E9Q8Q6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc141E9Q8Q6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc141E9Q8Q6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc141E9Q8Q6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc141E9Q8Q6 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc141E9Q8Q6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc141E9Q8Q6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc141E9Q8Q6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc141E9Q8Q6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc141E9Q8Q6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc141E9Q8Q6 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc141E9Q8Q6 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc141E9Q8Q6 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc141E9Q8Q6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc141E9Q8Q6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc141E9Q8Q6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc141E9Q8Q6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc141E9Q8Q6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc141E9Q8Q6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc141E9Q8Q6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc141E9Q8Q6 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc141E9Q8Q6 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc141E9Q8Q6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc141E9Q8Q6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc141E9Q8Q6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc141E9Q8Q6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc141E9Q8Q6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc141E9Q8Q6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc141E9Q8Q6 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc141E9Q8Q6 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc141E9Q8Q6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc141E9Q8Q6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc141E9Q8Q6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc141E9Q8Q6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc141E9Q8Q6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms