Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6D7

1700024B05Rik, RIKEN cDNA 1700024B05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700024B05RikE9Q6D7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
1700024B05RikE9Q6D7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms