Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccdc71lE9Q4T4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Ccdc71lE9Q4T4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc71lE9Q4T4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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