Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms